A Miskolci Egyetem Minőségbiztosítási Bizottsága (MBB) minden megvitatja és összeállítja az intézményi szintű, éves Minőségfejlesztési Programot, amely tartalmazza az intézmény egészére vonatkozó minőségellenőrzési, minőségbiztosítási akciókat és a minőségfejlesztési projekteket. Az intézményi Minőségfejlesztési Programok összeállítása a szervezeti egység szintű minőségfejlesztési tervekre épül, az MBB által elfogadott intézményi szintű Minőségfejlesztési Program végrehajtása viszont kötelező minden szervezeti egység számára. Az így elkészült tervezetet a Miskolci Egyetem Szenátusa minden éve első negyedévében tárgyalja, szükség esetén módosítja és elfogadja. Az intézményi szintű éves programok az alábbiakban letölthetőek:
2007-2008-as Minőségfejlesztési Program
2009-es Minőségfejlesztési Program
2010-es Minőségfejlesztési Program
2011-es Minőségfejlesztési Program
2012-es Minőségfejlesztési Program
2013-as Minőségfejlesztési Program
2014-es Minőségfejlesztési Program
2015-ös Minőségfejlesztési Program
2016-os Minőségfejlesztési Program
2017-es Minőségfejlesztési Program